Nem todos sobreviverão. Uma raça alienígena antiga, conhecida como ´Reapers´, lançou uma invasão total que deixou um rastro de destruição por onde passou. A Terra foi dominada, a galáxia está à beira da destruição e só você pode impedi-los. O preço do fracasso é a extinção. Seja o comandante Shepard, um personagem que você pode moldar como desejar. Você determina os eventos que participará, que planetas explorará e com quem formará alianças enquanto reúne uma força para eliminar a ameaça dos Reapers definitivamente.